La Giunta dell'Unione è presieduta dal Presidente ed opera attraverso deliberazioni collegiali. È composta da due Assessori, che coincidono con i Sindaci dei Comuni afferenti all'Unione. Ha competenza generale e residuale e quindi compie tutti gli atti di amministrazione che non siano riservati dalla legge al Consiglio e che non rientrino nelle competenze del Presidente, del Segretario o dei Dirigenti.